1、根據生產工藝要求必須控制潔凈室（區(qū)）內的微生物污染時，應進行潔凈室（區(qū)）內空氣中微生物污染的檢測。微生物污染的檢測可在三種占用狀態(tài)中的任一種狀態(tài)進行。宜采用浮游菌的測試方法和沉降菌的測試方法。
2、浮游菌的測試方法是通過采樣器采集在空氣中的活微生物粒子，通過專門的培養(yǎng)基，在適宜的生長條件下繁殖到可見的菌落數(shù)。浮游菌的測試方法應符合現(xiàn)行國家標準《醫(yī)藥工業(yè)潔凈室（區(qū)）浮游菌的測試方法》GB/T16293的要求。
3、沉降菌的測試方法是通過培養(yǎng)皿收集到的活微生物粒子，通過的培養(yǎng)基，在適宜的生長條件下繁殖到可見的菌落數(shù)。沉降菌的測試方法應符合現(xiàn)行國家標準《醫(yī)藥工業(yè)潔凈室（區(qū)）沉降菌的測試方法》GB/T16294的要求。
4、根據生產工藝要求必須控制潔凈室（區(qū)）內的微生物活粒子時，還可進行表面微生物污染測量。